Segue a estória de um rapaz do ensino médio chamado Sakuta, que possui uma irmã mais nova "hikikomori" (enfurnada em casa) chamada Kaede e este sempre está cuidando dela, mas ao longo do animê vai conhecendo outras garotas como uma espécie de "companheiro nas horas mais difíceis" delas. Tirando sua irmã, Sakuta conhece a primeira garota chamada Mai, cuja sua identidade fora perdida por causa dos "problemas de transtornos juvenis" e ninguém, com exceção de Sakuta, consegue mais ver e saber da existência de Mai. Daí a razão do título, pois como Mai não é enxergada por ninguém mesmo, resolve se vestir de "coelhinha" dentro de uma biblioteca pública e Sakuta, estando também lá, foi o único que a viu e conversou com ela, dando início a um relacionamento mais sério e envolvente entre os dois.
